Nachdem unsere tapferen Helden eine bittere Niederlage in der Festung des Schreckens erlitten haben, halten sie sich nun im Dorf Everwatch versteckt. Unweit des Dorfes, auf einer sumpfigen Waldlichtung, erheben sich die dunklen Mauern des Klosters von Doomgate. In den tiefen Gewölben wachen Kultisten über den dritten und begehrtesten Donnerstein: den Stein der Habgier.

Ziel des Spiels und eurer Queste ist es wieder, diesen uralten „Stein der Habgier“ aus den finsteren Gewölben des Doomgate-Klosters zu befreien. Neue schreckliche Monster und dämonische Wächter warten darauf besiegt zu werden. Doch diesmal hat man auch die Chance einmal etwas Gutes im Dungeon zu finden, den die neueste Erweiterung bringt mit den Schatzkarten sofort nutzbare Spielkarten für den Abenteurer auf den Tisch, der sie im Dungeon(-Kartendeck) findet. Das Dorf Everwatch bildet die zentralen Nachschubstapeln, bei denen man sich für die herausfordernde Mission rüsten, Helden und Söldner anheuern, machtvolle Waffen und mystische Zaubersprüche erwerben kann. Jeder Spieler stellt sich während des Spiels wieder nach und nach sein eigenes Kommandodeck zusammen. Eure Kommandodecks repräsentieren die Mitglieder, Eigenschaften und Ausrüstung eurer Heldengruppen. Dabei beginnen alle Mitstreiter wie schon im Grundspiel immer mit den gleichen Karten an Kämpfern und deren Ausrüstung. Durch „Die Wächter von Doomgate“ kommen nun zahlreiche neue Monster-, Helden- und Dorfkarten genau so ins Spiel wie die wertvollen Schätze und die (noch) grausameren Wächter.

Bestimmt man die Inhalte einer Partie „Thunderstone“ mittels der Zufallskarten – alternativ gibt es vorgegebene Settings, die man spielen kann – dann zeigt eine dieser ein „großes Fragezeichen“ mit dem Titel Dungeon-Merkmal. Diese Karte kann den Dungeon in einem Spiel mit bestimmten neuen Merkmalen wie z.B. mit Schätzen oder einem Wächter ausstatten. Falls man die Monster-Zufallskarte „Der Schwarm“ aufdeckt, fügt man dem Dungeondeck nur die Platzhalterkarten hinzu. Eventuell bestimmte Wächter kommen zunächst noch nicht ins Deck. Mischt die Monster-, Schatz- und Fallenkarten zum Dungeondeck zusammen. Das Dungeondeck wird nun mindestens 31 Karten beinhalten – eventuell aber mehr, abhängig eben von der Anzahl der Dungeon-Merkmale, die ihr gezogen habt. Ist mit den Schatzkarten zum ersten Mal etwas Gutes im Dungeon(-kartenstapel) für uns mutige Abenteurer zu finden, so ist diese Glück nur von kurzer Dauer. Denn da sind ja die neuen Wächter. Jeder Wächter hat nämlich einen speziellen „Durchbrucheffekt“, sobald er auf Position Eins des Dungeons gelangt. Dann verlässt der Wächter den Dungeon, um über das Dorf sprich die Nachziehkarten herzufallen! Und der Wächter wird zu allem Unbill auch noch aus dem Dungeon heraus gelegt, sprich nimmt vor den drei ausliegenden Monstern eines Dungeons die Position 0 ein.

Im Gegensatz zu normalen Durchbrucheffekten verfügt ein Wächter über einen dauerhaften Durchbrucheffekt. Sein Durchbrucheffekt betrifft alle Spieler. Zudem darf niemand den „Donnerstein“ aus dem Dungeon nehmen, solange sich ein Wächter auf Position 0 befindet. Wächter sind immun gegen jeden Effekt und jede Aktion, die bewirken würden, dass der Wächter den Dungeon (inklusive Position 0) verlassen oder seine Position verändern muss – nur durch einem erfolgreichen Kampf kann ein Wächter aus dem Dungeon bzw. von Position 0 entfernt werden. „Die Wächter von Doomgate“ beinhaltet zudem ein „Spezielles Krankheiten“-Deck, das 15 neue jetzt „schwerwiegendere Krankheiten“ wie „Aussatz“ oder „Elende Plage“ ins Spiel bringt, wodurch zum Beispiel durch die beiden genannten Preise im Dorf erhöhen oder sogar alle Helden einen Stärkeabzug erleiden können.